在微生物清洗室中设置清洁空调系统，是为了创造温度、湿度适当、空气清新、无菌清洁的微环境，有利于实验操作。传统的空调系统只能在一定程度上控制温度，清洁度无法完全控制，从而导致细菌滋生和繁殖。这种空调系统远远不能满足微生物实验室特定清洁环境的卫生要求。

洁净空调系统经一系列技术措施设计后，控制实验室内温度、灰尘、细菌、有害气体的浓度和气流分布，保证室内人员所需的新风量和室内合理气流流动，保持整个微生物实验室的适当梯度压力和定向流动，“无菌环境保障结构设计的另一个突出特点是大多数室内空调设备都保持在室外，这减少了非实验室人员进入实验室的机会，减少了污染，提高了实验室的利用率。

1、净化空调系统划分

每个洁净实验室都是独立的空调系统，缓冲室和洁净实验室是独立的空调，以防止内部交叉感染和危险气体泄漏。

2、空气处理净化过程

室内回风来自中效过滤器的回风端口(回风端口采用国家专利的固定风向可调风量回风端口，滤料在实验室内易于拆卸和更换)。通过回气管返回净化组合式空气处理器的回气段，冷却或加热，然后通过机组中的初级和中级效果过滤器(过滤器置于机组正压段)，从供气管送出到装有高效过滤器的供气端。室外新风考虑处理进入净化机组式空调机组的新风混合段，与室内的回风混合。经过卫生净化组合空气处理器的温湿度处理后，空气被均匀地送到洁净区。

3、送风方式及气流组织形式

实验室末端送风采用专用484送风静压箱。送风静压箱内充满了进口高效率低电阻无隔板高效率过滤器，底部设置有送风扩散板(扩散板和实验室顶棚平坦且无缝)。 局部百级实验室设置层流罩，采用垂直层流气流组织形式，外形尺寸为1240×35，内部充满了高效的过滤器，底部设置了均匀的扩散孔板。 洁净的室内回气是四角的底部回气，保证了室内气流的充分流动，带来了良好的稀释效果。 缓冲室在有效的送风口采用上下的回气流气流组织形式。